EDの抹消機能と暗号化強度に直接の関連性はありますか？

ありません。抹消機能はPCを中古に出した時や、HDDごと盗難にあった場合、悪意のある人間とPCや記録媒体（HDD、FDD、USBメモリなど）を共有する可能性がある場合などに対処するための機能です。例えば、暗号化したファイルをインターネット経由で送信する場合、抹消機能は通常関係ありません。